MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 plasmid BLNIAS_P2

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017222	AAT	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017222	AGA	2	6	196	201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017222	GCT	3	9	220	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
4	NC_017222	GCT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
5	NC_017222	CCG	2	6	331	336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202554
6	NC_017222	GC	3	6	378	383	0 %	0 %	50 %	50 %	384202554
7	NC_017222	CGG	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202554
8	NC_017222	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202554
9	NC_017222	TCG	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
10	NC_017222	TCG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
11	NC_017222	GCC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202554
12	NC_017222	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202554
13	NC_017222	GC	3	6	524	529	0 %	0 %	50 %	50 %	384202554
14	NC_017222	GC	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	384202554
15	NC_017222	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
16	NC_017222	CTC	2	6	608	613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202554
17	NC_017222	TCC	2	6	633	638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017222	ATCA	2	8	655	662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017222	GCA	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017222	AC	3	6	706	711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017222	GAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017222	TCA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202555
23	NC_017222	GCC	2	6	789	794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202555
24	NC_017222	CCG	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202555
25	NC_017222	CG	3	6	807	812	0 %	0 %	50 %	50 %	384202555
26	NC_017222	GGGA	2	8	825	832	25 %	0 %	75 %	0 %	384202555
27	NC_017222	ACCG	2	8	836	843	25 %	0 %	25 %	50 %	384202555
28	NC_017222	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202555
29	NC_017222	AATCC	2	10	928	937	40 %	20 %	0 %	40 %	384202555
30	NC_017222	CGAC	2	8	1001	1008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017222	GGT	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202556
32	NC_017222	GC	3	6	1106	1111	0 %	0 %	50 %	50 %	384202556
33	NC_017222	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
34	NC_017222	GCC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202556
35	NC_017222	CCT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202556
36	NC_017222	CGA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202556
37	NC_017222	TGC	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202556
38	NC_017222	GC	3	6	1429	1434	0 %	0 %	50 %	50 %	384202556
39	NC_017222	GAA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202556
40	NC_017222	GGA	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202556
41	NC_017222	GGAC	2	8	1640	1647	25 %	0 %	50 %	25 %	384202556
42	NC_017222	TCG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202556
43	NC_017222	GCG	2	6	1710	1715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
44	NC_017222	CGGC	2	8	1748	1755	0 %	0 %	50 %	50 %	384202556
45	NC_017222	AGA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202556
46	NC_017222	CAA	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202556
47	NC_017222	CCA	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202556
48	NC_017222	CGG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
49	NC_017222	GAG	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202556
50	NC_017222	CTC	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202556
51	NC_017222	GGC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202557
52	NC_017222	CGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
53	NC_017222	GC	3	6	2162	2167	0 %	0 %	50 %	50 %	384202557
54	NC_017222	CGC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
55	NC_017222	AACG	2	8	2328	2335	50 %	0 %	25 %	25 %	384202557
56	NC_017222	GGA	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202557
57	NC_017222	CCG	2	6	2395	2400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
58	NC_017222	CTG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202557
59	NC_017222	ATTG	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	384202557
60	NC_017222	CCAGC	2	10	2734	2743	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017222	AAT	2	6	2786	2791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017222	CTCG	2	8	2799	2806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017222	GCA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017222	CCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017222	CCCG	2	8	2883	2890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017222	GTG	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017222	CAG	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017222	T	6	6	3023	3028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017222	CCG	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017222	CATG	2	8	3225	3232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017222	AGC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017222	CCG	2	6	3268	3273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017222	CGT	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202558
74	NC_017222	ACCG	2	8	3336	3343	25 %	0 %	25 %	50 %	384202558
75	NC_017222	CCG	2	6	3352	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202558
76	NC_017222	CGCGG	2	10	3378	3387	0 %	0 %	60 %	40 %	384202558
77	NC_017222	CGAA	2	8	3390	3397	50 %	0 %	25 %	25 %	384202558
78	NC_017222	GCA	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202558
79	NC_017222	CGGC	2	8	3435	3442	0 %	0 %	50 %	50 %	384202559
80	NC_017222	GTCATC	2	12	3463	3474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384202559
81	NC_017222	CGGG	2	8	3610	3617	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017222	GGA	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017222	CTCC	2	8	3650	3657	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017222	TCT	2	6	3670	3675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017222	GC	3	6	3684	3689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017222	GCA	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
87	NC_017222	C	6	6	3798	3803	0 %	0 %	0 %	100 %	384202560
88	NC_017222	TGG	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202560
89	NC_017222	CGT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202560
90	NC_017222	GAA	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202560
91	NC_017222	ATG	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202560
92	NC_017222	GAC	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
93	NC_017222	CTG	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202560
94	NC_017222	CGG	2	6	4172	4177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202560
95	NC_017222	TCCGCG	2	12	4269	4280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384202560
96	NC_017222	ACG	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
97	NC_017222	GC	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	384202561
98	NC_017222	AC	3	6	4418	4423	50 %	0 %	0 %	50 %	384202561
99	NC_017222	AGC	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
100	NC_017222	CGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202561
101	NC_017222	GAC	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
102	NC_017222	GCA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
103	NC_017222	ACC	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202561
104	NC_017222	GACC	2	8	4749	4756	25 %	0 %	25 %	50 %	384202561
105	NC_017222	CGC	2	6	4814	4819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202561
106	NC_017222	GCAA	2	8	4975	4982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017222	CAA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017222	GGA	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017222	GCA	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017222	CCG	2	6	5264	5269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017222	AGT	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202562
112	NC_017222	CAC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202562
113	NC_017222	CG	3	6	5411	5416	0 %	0 %	50 %	50 %	384202562
114	NC_017222	GCC	2	6	5427	5432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202562
115	NC_017222	TCAAAT	2	12	5449	5460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384202562
116	NC_017222	CTT	3	9	5496	5504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202562
117	NC_017222	CAG	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202562
118	NC_017222	CTC	3	9	5547	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202562
119	NC_017222	TTG	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202562
120	NC_017222	CGG	2	6	5620	5625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202562
121	NC_017222	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	384202562
122	NC_017222	CCT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202562
123	NC_017222	GAGGT	2	10	5749	5758	20 %	20 %	60 %	0 %	384202562
124	NC_017222	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202562
125	NC_017222	TTC	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202562
126	NC_017222	TTG	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.